这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。在结束了在成都地区的旅行后 小智只带上了他最先获得的神奇宝贝——皮卡丘 来到了芳缘地方。但是在到芳缘地方的途中，皮卡丘被火箭队的攻击变得异常奇怪...在AG中，小智和新加入的女主角——小遥，永远支持着小智的小刚，以及小遥的弟弟小胜，一起在芳缘地方，以及到对战开拓区旅行
从小便能看见妖怪的少年夏目贵志。自从他从祖母玲子那里继承了与妖怪成为主从并将其名字书写在上的契约书“友人帐”以来，便与自称为保镖的妖怪猫咪老师一同，开始了将名字返还给妖怪的每一天。夏目与各种各样的妖怪与善良人们相遇，在构筑温暖的场所同时，也反复寄托着想要守护重要之物的想法。
梦原希美有时可能会笨手笨脚，但她总是开朗而积极。她是一名普通的初中生，却遇到了来自帕米尔王国的神秘妖精可可，为了守护大家的希望，她与朋友们联手，化身为希望之光、治愈之梦，共同面对对抗强大的敌人。时光流逝，希美和她的朋友们已经长大成人。他们各自走向未来。尽管她的工作、私人生活、朋友、家庭和爱情过着有趣而忙碌的生活，但她仍然在与成年以来所面临的问题和障碍作斗争。与此同时，攻击人类的神秘阴影突然出现……！当钟楼的钟声响起时，希美和她的朋友们长大成人的新故事开始了！
每个人都有不可告人的一面——这是一个世界各国均暗地里进行激烈情报战的时代。东国（Ostania）与西国（Westalis）的冷战状态已经持续数十年。“黄昏”是西国情报局东国对策科“WISE”的一名优秀间谍。为调查威胁东西两国和平的人物——东国国家统一党总裁多诺万·德斯蒙，上级给予了他一个绝密任务。任务名为：“枭”（Strix）行动。内容是“一周之内组建家庭，潜入德斯蒙儿子就读的名门学校的联谊会”。于是“黄昏”扮演成精神科医生劳埃德·福杰，开始组建家庭。然而，他找来的女儿阿尼亚是个能读心的超能力者，妻子约尔是个杀手。三人利害关系一致，便互相隐瞒身份，开始了共同生活。世界的和平，就掌握在这意外不断的临时一家人手中。
世界因僵尸大流行而崩溃。他保护了失去记忆并在陌生的地方醒来的美琴和住在这里的女友。
